Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CNTN1Q12860 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CNTN1Q12860 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CNTN1Q12860 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CNTN1Q12860 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CNTN1Q12860 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CNTN1Q12860 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CNTN1Q12860 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CNTN1Q12860 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CNTN1Q12860 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CNTN1Q12860 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CNTN1Q12860 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CNTN1Q12860 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CNTN1Q12860 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CNTN1Q12860 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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