Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
STX4Q12846 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
STX4Q12846 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
STX4Q12846 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
STX4Q12846 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
STX4Q12846 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
STX4Q12846 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
STX4Q12846 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
STX4Q12846 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
STX4Q12846 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
STX4Q12846 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
STX4Q12846 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
STX4Q12846 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
STX4Q12846 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
STX4Q12846 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
STX4Q12846 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
STX4Q12846 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
STX4Q12846 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
STX4Q12846 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
STX4Q12846 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
STX4Q12846 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
STX4Q12846 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
STX4Q12846 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
STX4Q12846 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
STX4Q12846 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
STX4Q12846 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
STX4Q12846 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
STX4Q12846 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
STX4Q12846 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
STX4Q12846 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
STX4Q12846 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
STX4Q12846 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
STX4Q12846 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
STX4Q12846 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
STX4Q12846 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
STX4Q12846 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
STX4Q12846 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
STX4Q12846 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
STX4Q12846 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
STX4Q12846 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
STX4Q12846 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
STX4Q12846 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
STX4Q12846 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
STX4Q12846 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
STX4Q12846 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
STX4Q12846 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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STX4Q12846 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
STX4Q12846 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
STX4Q12846 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
STX4Q12846 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
STX4Q12846 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
STX4Q12846 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
STX4Q12846 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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STX4Q12846 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
STX4Q12846 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
STX4Q12846 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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STX4Q12846 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
STX4Q12846 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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STX4Q12846 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
STX4Q12846 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
STX4Q12846 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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STX4Q12846 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
STX4Q12846 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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STX4Q12846 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
STX4Q12846 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
STX4Q12846 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
STX4Q12846 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
STX4Q12846 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
STX4Q12846 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
STX4Q12846 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
STX4Q12846 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
STX4Q12846 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
STX4Q12846 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
STX4Q12846 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
STX4Q12846 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
STX4Q12846 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
STX4Q12846 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
STX4Q12846 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
STX4Q12846 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
STX4Q12846 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
STX4Q12846 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
STX4Q12846 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
STX4Q12846 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
STX4Q12846 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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