Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
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