Protein–RNA interactions for Protein: Q10567

AP1B1, AP-1 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1B1Q10567 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
AP1B1Q10567 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
AP1B1Q10567 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
AP1B1Q10567 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
AP1B1Q10567 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
AP1B1Q10567 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
AP1B1Q10567 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
AP1B1Q10567 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
AP1B1Q10567 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
AP1B1Q10567 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
AP1B1Q10567 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
AP1B1Q10567 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
AP1B1Q10567 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
AP1B1Q10567 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
AP1B1Q10567 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
AP1B1Q10567 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
AP1B1Q10567 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
AP1B1Q10567 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
AP1B1Q10567 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
AP1B1Q10567 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
AP1B1Q10567 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
AP1B1Q10567 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
AP1B1Q10567 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
AP1B1Q10567 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
AP1B1Q10567 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
AP1B1Q10567 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
AP1B1Q10567 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
AP1B1Q10567 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
AP1B1Q10567 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
AP1B1Q10567 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
AP1B1Q10567 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
AP1B1Q10567 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
AP1B1Q10567 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
AP1B1Q10567 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
AP1B1Q10567 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
AP1B1Q10567 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
AP1B1Q10567 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
AP1B1Q10567 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
AP1B1Q10567 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
AP1B1Q10567 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
AP1B1Q10567 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
AP1B1Q10567 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
AP1B1Q10567 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
AP1B1Q10567 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
AP1B1Q10567 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
AP1B1Q10567 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
AP1B1Q10567 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
AP1B1Q10567 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
AP1B1Q10567 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
AP1B1Q10567 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
AP1B1Q10567 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
AP1B1Q10567 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
AP1B1Q10567 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
AP1B1Q10567 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
AP1B1Q10567 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
AP1B1Q10567 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
AP1B1Q10567 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
AP1B1Q10567 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
AP1B1Q10567 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
AP1B1Q10567 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
AP1B1Q10567 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
AP1B1Q10567 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
AP1B1Q10567 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
AP1B1Q10567 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
AP1B1Q10567 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
AP1B1Q10567 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
AP1B1Q10567 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
AP1B1Q10567 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
AP1B1Q10567 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
AP1B1Q10567 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
AP1B1Q10567 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
AP1B1Q10567 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
AP1B1Q10567 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
AP1B1Q10567 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
AP1B1Q10567 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
AP1B1Q10567 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
AP1B1Q10567 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
AP1B1Q10567 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
AP1B1Q10567 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
AP1B1Q10567 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
AP1B1Q10567 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
AP1B1Q10567 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
AP1B1Q10567 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
AP1B1Q10567 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
AP1B1Q10567 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
AP1B1Q10567 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
AP1B1Q10567 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
AP1B1Q10567 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
AP1B1Q10567 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
AP1B1Q10567 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
AP1B1Q10567 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
AP1B1Q10567 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
AP1B1Q10567 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
AP1B1Q10567 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
AP1B1Q10567 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
AP1B1Q10567 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
AP1B1Q10567 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
AP1B1Q10567 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
AP1B1Q10567 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
AP1B1Q10567 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms