Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOBRQ0VD83 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBRQ0VD83 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms