Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IFFO1Q0D2I5 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms