Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms