Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms