Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GABPAQ06546 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABPAQ06546 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms