Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CREMQ03060 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CREMQ03060 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CREMQ03060 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CREMQ03060 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CREMQ03060 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CREMQ03060 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CREMQ03060 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CREMQ03060 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CREMQ03060 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CREMQ03060 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CREMQ03060 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CREMQ03060 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CREMQ03060 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CREMQ03060 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CREMQ03060 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CREMQ03060 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CREMQ03060 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CREMQ03060 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CREMQ03060 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CREMQ03060 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CREMQ03060 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CREMQ03060 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CREMQ03060 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CREMQ03060 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CREMQ03060 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CREMQ03060 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CREMQ03060 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CREMQ03060 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CREMQ03060 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CREMQ03060 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CREMQ03060 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CREMQ03060 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CREMQ03060 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CREMQ03060 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CREMQ03060 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CREMQ03060 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CREMQ03060 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CREMQ03060 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CREMQ03060 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CREMQ03060 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CREMQ03060 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CREMQ03060 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CREMQ03060 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CREMQ03060 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CREMQ03060 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CREMQ03060 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CREMQ03060 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CREMQ03060 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CREMQ03060 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CREMQ03060 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CREMQ03060 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CREMQ03060 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CREMQ03060 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CREMQ03060 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CREMQ03060 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CREMQ03060 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CREMQ03060 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CREMQ03060 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CREMQ03060 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CREMQ03060 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CREMQ03060 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CREMQ03060 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CREMQ03060 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CREMQ03060 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CREMQ03060 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CREMQ03060 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CREMQ03060 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CREMQ03060 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CREMQ03060 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CREMQ03060 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CREMQ03060 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CREMQ03060 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CREMQ03060 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CREMQ03060 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CREMQ03060 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CREMQ03060 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CREMQ03060 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CREMQ03060 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CREMQ03060 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CREMQ03060 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CREMQ03060 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CREMQ03060 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CREMQ03060 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CREMQ03060 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CREMQ03060 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CREMQ03060 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CREMQ03060 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CREMQ03060 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CREMQ03060 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CREMQ03060 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CREMQ03060 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CREMQ03060 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CREMQ03060 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CREMQ03060 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CREMQ03060 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CREMQ03060 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CREMQ03060 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CREMQ03060 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CREMQ03060 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms