Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms