Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MDM2Q00987 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms