Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HSF1Q00613 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms