Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLTCQ00610 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CLTCQ00610 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLTCQ00610 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLTCQ00610 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CLTCQ00610 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLTCQ00610 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLTCQ00610 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLTCQ00610 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLTCQ00610 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLTCQ00610 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLTCQ00610 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLTCQ00610 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLTCQ00610 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLTCQ00610 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLTCQ00610 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLTCQ00610 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CLTCQ00610 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLTCQ00610 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLTCQ00610 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLTCQ00610 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLTCQ00610 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLTCQ00610 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CLTCQ00610 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLTCQ00610 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLTCQ00610 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLTCQ00610 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLTCQ00610 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLTCQ00610 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLTCQ00610 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLTCQ00610 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CLTCQ00610 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLTCQ00610 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLTCQ00610 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLTCQ00610 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CLTCQ00610 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLTCQ00610 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLTCQ00610 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLTCQ00610 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLTCQ00610 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLTCQ00610 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLTCQ00610 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLTCQ00610 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLTCQ00610 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLTCQ00610 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CLTCQ00610 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLTCQ00610 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLTCQ00610 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms