Protein–RNA interactions for Protein: P80303

NUCB2, Nucleobindin-2, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB2P80303 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUCB2P80303 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NUCB2P80303 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NUCB2P80303 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUCB2P80303 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms