Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERVK_113P63132 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms