Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARF3P61204 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARF3P61204 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARF3P61204 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARF3P61204 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ARF3P61204 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARF3P61204 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARF3P61204 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARF3P61204 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARF3P61204 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ARF3P61204 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARF3P61204 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARF3P61204 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARF3P61204 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARF3P61204 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARF3P61204 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARF3P61204 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARF3P61204 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARF3P61204 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ARF3P61204 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARF3P61204 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARF3P61204 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARF3P61204 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARF3P61204 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARF3P61204 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARF3P61204 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARF3P61204 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ARF3P61204 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARF3P61204 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARF3P61204 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARF3P61204 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARF3P61204 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARF3P61204 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ARF3P61204 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARF3P61204 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARF3P61204 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARF3P61204 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARF3P61204 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARF3P61204 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARF3P61204 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARF3P61204 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARF3P61204 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARF3P61204 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARF3P61204 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARF3P61204 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARF3P61204 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARF3P61204 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARF3P61204 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARF3P61204 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARF3P61204 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARF3P61204 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARF3P61204 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARF3P61204 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARF3P61204 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARF3P61204 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARF3P61204 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARF3P61204 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARF3P61204 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARF3P61204 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARF3P61204 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARF3P61204 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARF3P61204 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARF3P61204 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARF3P61204 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARF3P61204 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARF3P61204 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARF3P61204 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARF3P61204 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARF3P61204 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARF3P61204 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARF3P61204 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARF3P61204 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARF3P61204 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARF3P61204 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARF3P61204 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ARF3P61204 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ARF3P61204 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARF3P61204 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ARF3P61204 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARF3P61204 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARF3P61204 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARF3P61204 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARF3P61204 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARF3P61204 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARF3P61204 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARF3P61204 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARF3P61204 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARF3P61204 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARF3P61204 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARF3P61204 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARF3P61204 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARF3P61204 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARF3P61204 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARF3P61204 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARF3P61204 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARF3P61204 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARF3P61204 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARF3P61204 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ARF3P61204 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARF3P61204 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms