Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB25P57735 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB25P57735 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB25P57735 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB25P57735 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB25P57735 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB25P57735 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB25P57735 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB25P57735 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB25P57735 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB25P57735 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB25P57735 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB25P57735 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB25P57735 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB25P57735 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB25P57735 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB25P57735 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB25P57735 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB25P57735 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB25P57735 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB25P57735 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB25P57735 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB25P57735 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB25P57735 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB25P57735 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB25P57735 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB25P57735 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB25P57735 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB25P57735 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB25P57735 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB25P57735 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB25P57735 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB25P57735 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB25P57735 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB25P57735 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB25P57735 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB25P57735 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB25P57735 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB25P57735 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB25P57735 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB25P57735 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB25P57735 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB25P57735 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB25P57735 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB25P57735 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB25P57735 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB25P57735 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB25P57735 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB25P57735 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB25P57735 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB25P57735 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB25P57735 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB25P57735 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB25P57735 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB25P57735 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB25P57735 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB25P57735 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB25P57735 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
RAB25P57735 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RAB25P57735 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RAB25P57735 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
RAB25P57735 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB25P57735 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB25P57735 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB25P57735 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB25P57735 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB25P57735 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB25P57735 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB25P57735 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB25P57735 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB25P57735 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB25P57735 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB25P57735 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB25P57735 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB25P57735 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB25P57735 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB25P57735 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB25P57735 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB25P57735 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB25P57735 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB25P57735 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB25P57735 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB25P57735 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB25P57735 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB25P57735 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB25P57735 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB25P57735 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB25P57735 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB25P57735 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB25P57735 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB25P57735 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB25P57735 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB25P57735 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB25P57735 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB25P57735 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB25P57735 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB25P57735 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB25P57735 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB25P57735 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB25P57735 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms