Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BACE1P56817 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BACE1P56817 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BACE1P56817 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BACE1P56817 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BACE1P56817 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BACE1P56817 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
BACE1P56817 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BACE1P56817 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BACE1P56817 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BACE1P56817 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BACE1P56817 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BACE1P56817 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BACE1P56817 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BACE1P56817 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BACE1P56817 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BACE1P56817 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BACE1P56817 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
BACE1P56817 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
BACE1P56817 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
BACE1P56817 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
BACE1P56817 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BACE1P56817 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BACE1P56817 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
BACE1P56817 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BACE1P56817 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BACE1P56817 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
BACE1P56817 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BACE1P56817 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BACE1P56817 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BACE1P56817 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BACE1P56817 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BACE1P56817 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BACE1P56817 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BACE1P56817 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BACE1P56817 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BACE1P56817 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BACE1P56817 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BACE1P56817 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BACE1P56817 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BACE1P56817 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BACE1P56817 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BACE1P56817 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BACE1P56817 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BACE1P56817 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
BACE1P56817 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BACE1P56817 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BACE1P56817 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BACE1P56817 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BACE1P56817 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BACE1P56817 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
BACE1P56817 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BACE1P56817 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
BACE1P56817 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BACE1P56817 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BACE1P56817 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BACE1P56817 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BACE1P56817 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BACE1P56817 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BACE1P56817 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BACE1P56817 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BACE1P56817 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BACE1P56817 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BACE1P56817 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BACE1P56817 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BACE1P56817 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BACE1P56817 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BACE1P56817 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BACE1P56817 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BACE1P56817 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BACE1P56817 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BACE1P56817 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BACE1P56817 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BACE1P56817 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
BACE1P56817 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
BACE1P56817 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BACE1P56817 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BACE1P56817 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
BACE1P56817 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BACE1P56817 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BACE1P56817 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BACE1P56817 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BACE1P56817 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
BACE1P56817 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BACE1P56817 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BACE1P56817 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BACE1P56817 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BACE1P56817 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BACE1P56817 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BACE1P56817 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BACE1P56817 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BACE1P56817 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BACE1P56817 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BACE1P56817 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BACE1P56817 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BACE1P56817 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BACE1P56817 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BACE1P56817 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BACE1P56817 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BACE1P56817 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms