Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASP7P55210 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CASP7P55210 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASP7P55210 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASP7P55210 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASP7P55210 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASP7P55210 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASP7P55210 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASP7P55210 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASP7P55210 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASP7P55210 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASP7P55210 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CASP7P55210 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASP7P55210 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASP7P55210 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASP7P55210 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASP7P55210 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASP7P55210 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASP7P55210 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASP7P55210 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASP7P55210 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASP7P55210 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CASP7P55210 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CASP7P55210 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASP7P55210 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASP7P55210 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASP7P55210 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASP7P55210 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASP7P55210 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASP7P55210 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASP7P55210 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASP7P55210 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASP7P55210 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASP7P55210 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASP7P55210 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASP7P55210 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASP7P55210 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASP7P55210 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASP7P55210 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASP7P55210 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASP7P55210 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASP7P55210 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASP7P55210 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASP7P55210 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASP7P55210 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASP7P55210 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASP7P55210 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASP7P55210 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CASP7P55210 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASP7P55210 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASP7P55210 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASP7P55210 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASP7P55210 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASP7P55210 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASP7P55210 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASP7P55210 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASP7P55210 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASP7P55210 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASP7P55210 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASP7P55210 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASP7P55210 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASP7P55210 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASP7P55210 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASP7P55210 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASP7P55210 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASP7P55210 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CASP7P55210 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASP7P55210 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASP7P55210 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASP7P55210 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASP7P55210 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASP7P55210 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASP7P55210 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP7P55210 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP7P55210 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP7P55210 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP7P55210 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP7P55210 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP7P55210 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP7P55210 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP7P55210 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP7P55210 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP7P55210 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP7P55210 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP7P55210 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP7P55210 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP7P55210 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP7P55210 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP7P55210 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP7P55210 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP7P55210 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP7P55210 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP7P55210 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASP7P55210 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASP7P55210 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASP7P55210 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASP7P55210 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASP7P55210 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASP7P55210 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASP7P55210 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms