Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
AFDNP55196 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AFDNP55196 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AFDNP55196 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AFDNP55196 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AFDNP55196 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AFDNP55196 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AFDNP55196 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AFDNP55196 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AFDNP55196 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AFDNP55196 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AFDNP55196 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AFDNP55196 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
AFDNP55196 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AFDNP55196 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AFDNP55196 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AFDNP55196 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AFDNP55196 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AFDNP55196 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AFDNP55196 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AFDNP55196 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AFDNP55196 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AFDNP55196 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AFDNP55196 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AFDNP55196 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AFDNP55196 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AFDNP55196 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AFDNP55196 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AFDNP55196 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AFDNP55196 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AFDNP55196 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AFDNP55196 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AFDNP55196 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AFDNP55196 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AFDNP55196 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
AFDNP55196 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AFDNP55196 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AFDNP55196 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
AFDNP55196 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AFDNP55196 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
AFDNP55196 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AFDNP55196 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AFDNP55196 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AFDNP55196 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AFDNP55196 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AFDNP55196 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
AFDNP55196 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AFDNP55196 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AFDNP55196 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AFDNP55196 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AFDNP55196 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
AFDNP55196 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
AFDNP55196 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
AFDNP55196 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
AFDNP55196 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
AFDNP55196 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
AFDNP55196 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
AFDNP55196 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AFDNP55196 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AFDNP55196 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AFDNP55196 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AFDNP55196 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AFDNP55196 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AFDNP55196 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AFDNP55196 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AFDNP55196 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
AFDNP55196 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AFDNP55196 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
AFDNP55196 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AFDNP55196 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AFDNP55196 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AFDNP55196 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AFDNP55196 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AFDNP55196 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AFDNP55196 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AFDNP55196 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AFDNP55196 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AFDNP55196 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AFDNP55196 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AFDNP55196 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AFDNP55196 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AFDNP55196 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AFDNP55196 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AFDNP55196 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AFDNP55196 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AFDNP55196 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
AFDNP55196 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AFDNP55196 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
AFDNP55196 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AFDNP55196 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AFDNP55196 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
AFDNP55196 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AFDNP55196 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AFDNP55196 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AFDNP55196 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AFDNP55196 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AFDNP55196 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AFDNP55196 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AFDNP55196 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AFDNP55196 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms