Protein–RNA interactions for Protein: P53367

ARFIP1, Arfaptin-1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP1P53367 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ARFIP1P53367 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARFIP1P53367 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARFIP1P53367 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARFIP1P53367 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARFIP1P53367 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARFIP1P53367 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARFIP1P53367 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARFIP1P53367 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARFIP1P53367 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARFIP1P53367 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ARFIP1P53367 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARFIP1P53367 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARFIP1P53367 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARFIP1P53367 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARFIP1P53367 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARFIP1P53367 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARFIP1P53367 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARFIP1P53367 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARFIP1P53367 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ARFIP1P53367 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARFIP1P53367 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARFIP1P53367 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARFIP1P53367 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARFIP1P53367 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARFIP1P53367 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARFIP1P53367 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARFIP1P53367 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARFIP1P53367 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARFIP1P53367 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARFIP1P53367 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARFIP1P53367 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARFIP1P53367 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARFIP1P53367 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARFIP1P53367 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARFIP1P53367 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARFIP1P53367 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARFIP1P53367 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARFIP1P53367 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARFIP1P53367 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARFIP1P53367 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARFIP1P53367 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARFIP1P53367 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARFIP1P53367 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARFIP1P53367 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARFIP1P53367 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARFIP1P53367 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARFIP1P53367 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARFIP1P53367 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARFIP1P53367 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARFIP1P53367 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARFIP1P53367 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARFIP1P53367 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARFIP1P53367 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ARFIP1P53367 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ARFIP1P53367 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARFIP1P53367 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARFIP1P53367 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARFIP1P53367 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARFIP1P53367 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARFIP1P53367 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARFIP1P53367 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARFIP1P53367 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARFIP1P53367 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ARFIP1P53367 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARFIP1P53367 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARFIP1P53367 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms