Protein–RNA interactions for Protein: P51884

LUM, Lumican, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LUMP51884 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LUMP51884 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LUMP51884 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LUMP51884 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LUMP51884 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LUMP51884 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LUMP51884 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LUMP51884 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LUMP51884 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LUMP51884 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LUMP51884 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LUMP51884 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LUMP51884 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LUMP51884 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LUMP51884 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LUMP51884 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LUMP51884 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LUMP51884 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LUMP51884 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LUMP51884 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LUMP51884 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LUMP51884 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LUMP51884 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LUMP51884 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LUMP51884 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LUMP51884 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LUMP51884 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LUMP51884 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LUMP51884 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LUMP51884 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LUMP51884 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LUMP51884 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LUMP51884 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LUMP51884 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LUMP51884 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LUMP51884 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LUMP51884 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LUMP51884 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LUMP51884 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LUMP51884 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LUMP51884 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LUMP51884 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LUMP51884 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LUMP51884 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LUMP51884 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LUMP51884 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LUMP51884 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LUMP51884 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LUMP51884 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LUMP51884 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LUMP51884 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LUMP51884 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LUMP51884 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LUMP51884 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LUMP51884 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LUMP51884 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LUMP51884 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LUMP51884 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LUMP51884 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LUMP51884 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LUMP51884 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LUMP51884 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LUMP51884 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LUMP51884 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LUMP51884 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LUMP51884 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LUMP51884 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LUMP51884 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LUMP51884 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LUMP51884 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LUMP51884 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LUMP51884 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LUMP51884 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LUMP51884 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LUMP51884 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LUMP51884 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LUMP51884 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LUMP51884 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LUMP51884 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LUMP51884 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LUMP51884 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LUMP51884 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LUMP51884 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LUMP51884 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LUMP51884 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LUMP51884 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LUMP51884 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LUMP51884 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LUMP51884 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LUMP51884 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LUMP51884 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LUMP51884 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LUMP51884 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LUMP51884 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LUMP51884 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LUMP51884 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LUMP51884 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LUMP51884 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LUMP51884 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LUMP51884 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms