Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ME1P48163 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ME1P48163 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ME1P48163 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ME1P48163 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ME1P48163 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ME1P48163 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ME1P48163 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ME1P48163 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ME1P48163 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ME1P48163 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ME1P48163 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ME1P48163 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ME1P48163 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ME1P48163 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ME1P48163 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ME1P48163 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ME1P48163 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ME1P48163 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ME1P48163 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ME1P48163 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ME1P48163 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ME1P48163 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ME1P48163 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ME1P48163 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ME1P48163 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ME1P48163 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ME1P48163 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ME1P48163 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ME1P48163 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ME1P48163 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ME1P48163 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ME1P48163 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ME1P48163 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ME1P48163 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ME1P48163 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ME1P48163 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ME1P48163 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ME1P48163 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ME1P48163 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ME1P48163 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ME1P48163 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ME1P48163 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ME1P48163 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ME1P48163 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ME1P48163 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ME1P48163 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ME1P48163 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ME1P48163 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ME1P48163 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ME1P48163 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ME1P48163 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ME1P48163 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ME1P48163 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ME1P48163 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ME1P48163 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ME1P48163 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ME1P48163 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ME1P48163 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ME1P48163 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ME1P48163 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ME1P48163 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ME1P48163 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ME1P48163 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ME1P48163 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ME1P48163 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ME1P48163 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ME1P48163 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ME1P48163 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ME1P48163 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ME1P48163 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ME1P48163 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ME1P48163 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ME1P48163 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ME1P48163 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ME1P48163 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ME1P48163 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ME1P48163 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ME1P48163 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ME1P48163 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ME1P48163 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ME1P48163 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ME1P48163 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ME1P48163 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ME1P48163 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ME1P48163 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ME1P48163 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ME1P48163 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ME1P48163 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ME1P48163 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ME1P48163 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ME1P48163 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ME1P48163 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ME1P48163 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ME1P48163 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ME1P48163 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ME1P48163 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ME1P48163 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ME1P48163 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ME1P48163 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms