Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NEDD4P46934 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEDD4P46934 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms