Protein–RNA interactions for Protein: P46020

PHKA1, Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHKA1P46020 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHKA1P46020 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PHKA1P46020 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms