Protein–RNA interactions for Protein: P43897

TSFM, Elongation factor Ts, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSFMP43897 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSFMP43897 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSFMP43897 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSFMP43897 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSFMP43897 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSFMP43897 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSFMP43897 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TSFMP43897 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSFMP43897 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSFMP43897 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TSFMP43897 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSFMP43897 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSFMP43897 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TSFMP43897 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSFMP43897 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSFMP43897 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSFMP43897 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSFMP43897 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSFMP43897 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSFMP43897 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSFMP43897 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSFMP43897 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSFMP43897 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSFMP43897 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSFMP43897 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSFMP43897 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSFMP43897 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSFMP43897 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSFMP43897 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSFMP43897 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSFMP43897 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSFMP43897 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TSFMP43897 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSFMP43897 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSFMP43897 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSFMP43897 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSFMP43897 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TSFMP43897 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSFMP43897 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSFMP43897 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSFMP43897 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSFMP43897 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSFMP43897 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSFMP43897 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TSFMP43897 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TSFMP43897 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TSFMP43897 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSFMP43897 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSFMP43897 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSFMP43897 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSFMP43897 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSFMP43897 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSFMP43897 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSFMP43897 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSFMP43897 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSFMP43897 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSFMP43897 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSFMP43897 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSFMP43897 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSFMP43897 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSFMP43897 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSFMP43897 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSFMP43897 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSFMP43897 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSFMP43897 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSFMP43897 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TSFMP43897 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSFMP43897 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSFMP43897 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSFMP43897 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSFMP43897 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSFMP43897 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSFMP43897 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSFMP43897 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSFMP43897 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSFMP43897 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSFMP43897 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSFMP43897 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSFMP43897 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSFMP43897 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSFMP43897 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSFMP43897 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSFMP43897 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSFMP43897 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSFMP43897 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSFMP43897 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSFMP43897 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSFMP43897 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSFMP43897 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSFMP43897 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSFMP43897 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSFMP43897 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSFMP43897 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSFMP43897 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSFMP43897 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSFMP43897 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSFMP43897 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSFMP43897 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TSFMP43897 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSFMP43897 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms