Protein–RNA interactions for Protein: P43146

DCC, Netrin receptor DCC, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCCP43146 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DCCP43146 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DCCP43146 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DCCP43146 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DCCP43146 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DCCP43146 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DCCP43146 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DCCP43146 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DCCP43146 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DCCP43146 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
DCCP43146 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DCCP43146 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DCCP43146 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DCCP43146 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DCCP43146 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DCCP43146 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DCCP43146 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DCCP43146 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DCCP43146 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DCCP43146 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DCCP43146 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
DCCP43146 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
DCCP43146 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DCCP43146 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DCCP43146 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DCCP43146 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DCCP43146 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DCCP43146 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DCCP43146 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DCCP43146 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DCCP43146 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DCCP43146 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DCCP43146 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DCCP43146 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DCCP43146 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DCCP43146 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DCCP43146 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DCCP43146 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DCCP43146 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DCCP43146 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
DCCP43146 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DCCP43146 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DCCP43146 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DCCP43146 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DCCP43146 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DCCP43146 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DCCP43146 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
DCCP43146 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DCCP43146 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DCCP43146 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DCCP43146 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DCCP43146 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DCCP43146 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DCCP43146 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DCCP43146 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DCCP43146 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DCCP43146 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DCCP43146 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DCCP43146 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DCCP43146 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
DCCP43146 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DCCP43146 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DCCP43146 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DCCP43146 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DCCP43146 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DCCP43146 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DCCP43146 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DCCP43146 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DCCP43146 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DCCP43146 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DCCP43146 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DCCP43146 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
DCCP43146 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
DCCP43146 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DCCP43146 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DCCP43146 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DCCP43146 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DCCP43146 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DCCP43146 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DCCP43146 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DCCP43146 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DCCP43146 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DCCP43146 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DCCP43146 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
DCCP43146 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
DCCP43146 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
DCCP43146 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
DCCP43146 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
DCCP43146 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
DCCP43146 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
DCCP43146 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DCCP43146 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DCCP43146 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DCCP43146 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DCCP43146 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DCCP43146 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DCCP43146 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DCCP43146 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DCCP43146 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DCCP43146 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms