Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
ITGAEP38570 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ITGAEP38570 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ITGAEP38570 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ITGAEP38570 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
ITGAEP38570 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
ITGAEP38570 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ITGAEP38570 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ITGAEP38570 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ITGAEP38570 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ITGAEP38570 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
ITGAEP38570 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ITGAEP38570 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ITGAEP38570 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ITGAEP38570 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ITGAEP38570 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ITGAEP38570 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ITGAEP38570 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ITGAEP38570 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ITGAEP38570 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
ITGAEP38570 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ITGAEP38570 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ITGAEP38570 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ITGAEP38570 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ITGAEP38570 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ITGAEP38570 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ITGAEP38570 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ITGAEP38570 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ITGAEP38570 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ITGAEP38570 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ITGAEP38570 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ITGAEP38570 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ITGAEP38570 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ITGAEP38570 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ITGAEP38570 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ITGAEP38570 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ITGAEP38570 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ITGAEP38570 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ITGAEP38570 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ITGAEP38570 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ITGAEP38570 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ITGAEP38570 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ITGAEP38570 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ITGAEP38570 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ITGAEP38570 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ITGAEP38570 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ITGAEP38570 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ITGAEP38570 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ITGAEP38570 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ITGAEP38570 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ITGAEP38570 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ITGAEP38570 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ITGAEP38570 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ITGAEP38570 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ITGAEP38570 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ITGAEP38570 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ITGAEP38570 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ITGAEP38570 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ITGAEP38570 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
ITGAEP38570 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ITGAEP38570 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
ITGAEP38570 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
ITGAEP38570 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ITGAEP38570 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ITGAEP38570 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ITGAEP38570 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ITGAEP38570 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ITGAEP38570 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ITGAEP38570 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ITGAEP38570 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ITGAEP38570 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ITGAEP38570 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ITGAEP38570 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ITGAEP38570 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ITGAEP38570 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ITGAEP38570 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ITGAEP38570 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ITGAEP38570 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ITGAEP38570 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ITGAEP38570 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ITGAEP38570 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ITGAEP38570 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ITGAEP38570 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ITGAEP38570 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ITGAEP38570 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ITGAEP38570 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ITGAEP38570 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ITGAEP38570 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ITGAEP38570 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ITGAEP38570 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
ITGAEP38570 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ITGAEP38570 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ITGAEP38570 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ITGAEP38570 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ITGAEP38570 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ITGAEP38570 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ITGAEP38570 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ITGAEP38570 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ITGAEP38570 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms