Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHI3L1P36222 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHI3L1P36222 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms