Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD12P35452 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms