Protein–RNA interactions for Protein: P35408

PTGER4, Prostaglandin E2 receptor EP4 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER4P35408 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTGER4P35408 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTGER4P35408 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTGER4P35408 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTGER4P35408 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTGER4P35408 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTGER4P35408 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTGER4P35408 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTGER4P35408 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTGER4P35408 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTGER4P35408 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTGER4P35408 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTGER4P35408 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTGER4P35408 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PTGER4P35408 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTGER4P35408 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTGER4P35408 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTGER4P35408 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTGER4P35408 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTGER4P35408 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTGER4P35408 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTGER4P35408 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTGER4P35408 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTGER4P35408 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTGER4P35408 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTGER4P35408 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTGER4P35408 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTGER4P35408 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTGER4P35408 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTGER4P35408 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTGER4P35408 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGER4P35408 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGER4P35408 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGER4P35408 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGER4P35408 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGER4P35408 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGER4P35408 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGER4P35408 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGER4P35408 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGER4P35408 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGER4P35408 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGER4P35408 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGER4P35408 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGER4P35408 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGER4P35408 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGER4P35408 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGER4P35408 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGER4P35408 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGER4P35408 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGER4P35408 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGER4P35408 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGER4P35408 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGER4P35408 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGER4P35408 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGER4P35408 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGER4P35408 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGER4P35408 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGER4P35408 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGER4P35408 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGER4P35408 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGER4P35408 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGER4P35408 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGER4P35408 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGER4P35408 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGER4P35408 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGER4P35408 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGER4P35408 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGER4P35408 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGER4P35408 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGER4P35408 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTGER4P35408 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTGER4P35408 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTGER4P35408 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTGER4P35408 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
PTGER4P35408 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PTGER4P35408 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTGER4P35408 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTGER4P35408 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTGER4P35408 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTGER4P35408 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
PTGER4P35408 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTGER4P35408 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTGER4P35408 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTGER4P35408 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTGER4P35408 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTGER4P35408 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTGER4P35408 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTGER4P35408 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PTGER4P35408 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTGER4P35408 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PTGER4P35408 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTGER4P35408 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTGER4P35408 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTGER4P35408 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTGER4P35408 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTGER4P35408 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTGER4P35408 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTGER4P35408 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTGER4P35408 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTGER4P35408 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms