Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms