Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CMPK1P30085 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms