Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD10P28358 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD10P28358 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD10P28358 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD10P28358 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD10P28358 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD10P28358 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD10P28358 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD10P28358 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD10P28358 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD10P28358 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD10P28358 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD10P28358 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD10P28358 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD10P28358 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD10P28358 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD10P28358 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD10P28358 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD10P28358 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD10P28358 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD10P28358 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD10P28358 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD10P28358 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD10P28358 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD10P28358 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD10P28358 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXD10P28358 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
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HOXD10P28358 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXD10P28358 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
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HOXD10P28358 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXD10P28358 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXD10P28358 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXD10P28358 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXD10P28358 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXD10P28358 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
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HOXD10P28358 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXD10P28358 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXD10P28358 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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HOXD10P28358 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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HOXD10P28358 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXD10P28358 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXD10P28358 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXD10P28358 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXD10P28358 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXD10P28358 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXD10P28358 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXD10P28358 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
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HOXD10P28358 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXD10P28358 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXD10P28358 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
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HOXD10P28358 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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HOXD10P28358 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXD10P28358 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
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HOXD10P28358 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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HOXD10P28358 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
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HOXD10P28358 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXD10P28358 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXD10P28358 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXD10P28358 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXD10P28358 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXD10P28358 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXD10P28358 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXD10P28358 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HOXD10P28358 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HOXD10P28358 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HOXD10P28358 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HOXD10P28358 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HOXD10P28358 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HOXD10P28358 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HOXD10P28358 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HOXD10P28358 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
HOXD10P28358 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
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