Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms