Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAMP1P23763 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms