Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGA6P23229 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms