Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms