Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC9A1P19634 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC9A1P19634 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC9A1P19634 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC9A1P19634 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC9A1P19634 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC9A1P19634 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC9A1P19634 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC9A1P19634 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC9A1P19634 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC9A1P19634 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC9A1P19634 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC9A1P19634 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC9A1P19634 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC9A1P19634 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC9A1P19634 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC9A1P19634 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC9A1P19634 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC9A1P19634 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC9A1P19634 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC9A1P19634 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC9A1P19634 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC9A1P19634 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC9A1P19634 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC9A1P19634 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC9A1P19634 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC9A1P19634 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC9A1P19634 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC9A1P19634 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC9A1P19634 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC9A1P19634 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC9A1P19634 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC9A1P19634 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC9A1P19634 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC9A1P19634 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC9A1P19634 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC9A1P19634 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC9A1P19634 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC9A1P19634 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC9A1P19634 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC9A1P19634 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC9A1P19634 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC9A1P19634 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC9A1P19634 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC9A1P19634 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC9A1P19634 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC9A1P19634 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC9A1P19634 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC9A1P19634 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC9A1P19634 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC9A1P19634 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC9A1P19634 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC9A1P19634 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC9A1P19634 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC9A1P19634 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC9A1P19634 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC9A1P19634 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC9A1P19634 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC9A1P19634 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC9A1P19634 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC9A1P19634 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC9A1P19634 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC9A1P19634 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC9A1P19634 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC9A1P19634 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC9A1P19634 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC9A1P19634 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC9A1P19634 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC9A1P19634 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC9A1P19634 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC9A1P19634 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC9A1P19634 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC9A1P19634 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC9A1P19634 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC9A1P19634 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC9A1P19634 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC9A1P19634 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC9A1P19634 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC9A1P19634 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC9A1P19634 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC9A1P19634 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC9A1P19634 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC9A1P19634 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC9A1P19634 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC9A1P19634 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC9A1P19634 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC9A1P19634 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC9A1P19634 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC9A1P19634 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC9A1P19634 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC9A1P19634 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC9A1P19634 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC9A1P19634 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC9A1P19634 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC9A1P19634 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC9A1P19634 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC9A1P19634 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC9A1P19634 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC9A1P19634 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC9A1P19634 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms