Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
HOXD8P13378 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
HOXD8P13378 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
HOXD8P13378 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
HOXD8P13378 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD8P13378 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD8P13378 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD8P13378 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD8P13378 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD8P13378 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD8P13378 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD8P13378 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD8P13378 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD8P13378 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD8P13378 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD8P13378 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD8P13378 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD8P13378 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD8P13378 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD8P13378 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD8P13378 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD8P13378 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD8P13378 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD8P13378 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD8P13378 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD8P13378 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD8P13378 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD8P13378 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD8P13378 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD8P13378 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXD8P13378 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXD8P13378 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXD8P13378 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXD8P13378 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXD8P13378 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXD8P13378 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXD8P13378 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXD8P13378 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXD8P13378 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXD8P13378 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXD8P13378 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXD8P13378 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXD8P13378 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXD8P13378 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXD8P13378 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXD8P13378 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXD8P13378 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXD8P13378 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXD8P13378 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXD8P13378 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXD8P13378 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXD8P13378 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXD8P13378 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXD8P13378 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXD8P13378 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXD8P13378 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXD8P13378 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXD8P13378 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXD8P13378 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXD8P13378 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXD8P13378 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXD8P13378 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXD8P13378 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXD8P13378 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXD8P13378 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXD8P13378 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXD8P13378 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXD8P13378 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXD8P13378 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXD8P13378 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXD8P13378 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXD8P13378 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXD8P13378 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXD8P13378 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXD8P13378 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXD8P13378 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD8P13378 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD8P13378 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD8P13378 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD8P13378 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD8P13378 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD8P13378 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD8P13378 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD8P13378 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD8P13378 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD8P13378 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD8P13378 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD8P13378 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD8P13378 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD8P13378 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD8P13378 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD8P13378 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD8P13378 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD8P13378 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD8P13378 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD8P13378 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXD8P13378 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXD8P13378 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXD8P13378 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms