Protein–RNA interactions for Protein: P12980

LYL1, Protein lyl-1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYL1P12980 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYL1P12980 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LYL1P12980 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYL1P12980 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYL1P12980 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYL1P12980 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYL1P12980 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYL1P12980 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYL1P12980 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYL1P12980 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYL1P12980 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYL1P12980 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYL1P12980 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYL1P12980 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYL1P12980 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYL1P12980 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYL1P12980 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYL1P12980 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYL1P12980 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYL1P12980 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LYL1P12980 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYL1P12980 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYL1P12980 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYL1P12980 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYL1P12980 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYL1P12980 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYL1P12980 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYL1P12980 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYL1P12980 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYL1P12980 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYL1P12980 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYL1P12980 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYL1P12980 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYL1P12980 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYL1P12980 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYL1P12980 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYL1P12980 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYL1P12980 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LYL1P12980 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYL1P12980 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYL1P12980 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYL1P12980 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYL1P12980 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYL1P12980 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LYL1P12980 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYL1P12980 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYL1P12980 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LYL1P12980 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYL1P12980 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYL1P12980 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYL1P12980 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYL1P12980 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYL1P12980 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYL1P12980 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYL1P12980 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYL1P12980 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYL1P12980 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYL1P12980 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LYL1P12980 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYL1P12980 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYL1P12980 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYL1P12980 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYL1P12980 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYL1P12980 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYL1P12980 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYL1P12980 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYL1P12980 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYL1P12980 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYL1P12980 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYL1P12980 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYL1P12980 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYL1P12980 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYL1P12980 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYL1P12980 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYL1P12980 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYL1P12980 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYL1P12980 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYL1P12980 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYL1P12980 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYL1P12980 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYL1P12980 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYL1P12980 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYL1P12980 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYL1P12980 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYL1P12980 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LYL1P12980 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYL1P12980 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYL1P12980 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYL1P12980 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYL1P12980 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYL1P12980 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYL1P12980 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYL1P12980 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYL1P12980 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYL1P12980 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYL1P12980 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
LYL1P12980 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYL1P12980 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYL1P12980 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYL1P12980 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms