Protein–RNA interactions for Protein: P12644

BMP4, Bone morphogenetic protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP4P12644 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BMP4P12644 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BMP4P12644 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BMP4P12644 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BMP4P12644 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BMP4P12644 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BMP4P12644 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
BMP4P12644 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BMP4P12644 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BMP4P12644 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BMP4P12644 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BMP4P12644 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BMP4P12644 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BMP4P12644 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BMP4P12644 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BMP4P12644 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BMP4P12644 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BMP4P12644 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BMP4P12644 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BMP4P12644 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BMP4P12644 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BMP4P12644 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BMP4P12644 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BMP4P12644 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BMP4P12644 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BMP4P12644 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BMP4P12644 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BMP4P12644 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BMP4P12644 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BMP4P12644 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BMP4P12644 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BMP4P12644 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
BMP4P12644 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BMP4P12644 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BMP4P12644 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BMP4P12644 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BMP4P12644 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BMP4P12644 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BMP4P12644 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BMP4P12644 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BMP4P12644 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BMP4P12644 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BMP4P12644 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BMP4P12644 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BMP4P12644 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BMP4P12644 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BMP4P12644 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BMP4P12644 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BMP4P12644 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BMP4P12644 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BMP4P12644 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BMP4P12644 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BMP4P12644 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BMP4P12644 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BMP4P12644 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BMP4P12644 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BMP4P12644 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BMP4P12644 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BMP4P12644 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BMP4P12644 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BMP4P12644 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BMP4P12644 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BMP4P12644 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BMP4P12644 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BMP4P12644 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BMP4P12644 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BMP4P12644 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BMP4P12644 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BMP4P12644 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BMP4P12644 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BMP4P12644 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BMP4P12644 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BMP4P12644 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BMP4P12644 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BMP4P12644 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BMP4P12644 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BMP4P12644 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BMP4P12644 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
BMP4P12644 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BMP4P12644 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BMP4P12644 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BMP4P12644 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BMP4P12644 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BMP4P12644 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BMP4P12644 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BMP4P12644 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BMP4P12644 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BMP4P12644 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BMP4P12644 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BMP4P12644 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
BMP4P12644 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BMP4P12644 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BMP4P12644 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BMP4P12644 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BMP4P12644 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BMP4P12644 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BMP4P12644 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BMP4P12644 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BMP4P12644 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BMP4P12644 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms