Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD3P0DMS9 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms