Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGA3P0DJD8 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms