Protein–RNA interactions for Protein: P09238

MMP10, Stromelysin-2, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP10P09238 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP10P09238 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP10P09238 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP10P09238 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP10P09238 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP10P09238 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP10P09238 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP10P09238 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MMP10P09238 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MMP10P09238 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MMP10P09238 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MMP10P09238 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MMP10P09238 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MMP10P09238 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MMP10P09238 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MMP10P09238 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MMP10P09238 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MMP10P09238 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MMP10P09238 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MMP10P09238 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MMP10P09238 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MMP10P09238 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MMP10P09238 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MMP10P09238 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MMP10P09238 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MMP10P09238 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MMP10P09238 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MMP10P09238 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MMP10P09238 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MMP10P09238 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MMP10P09238 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MMP10P09238 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MMP10P09238 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MMP10P09238 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MMP10P09238 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MMP10P09238 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MMP10P09238 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MMP10P09238 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MMP10P09238 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MMP10P09238 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MMP10P09238 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MMP10P09238 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MMP10P09238 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MMP10P09238 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MMP10P09238 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MMP10P09238 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MMP10P09238 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MMP10P09238 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MMP10P09238 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MMP10P09238 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MMP10P09238 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MMP10P09238 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MMP10P09238 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MMP10P09238 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MMP10P09238 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MMP10P09238 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MMP10P09238 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MMP10P09238 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MMP10P09238 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MMP10P09238 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MMP10P09238 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MMP10P09238 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MMP10P09238 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MMP10P09238 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MMP10P09238 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MMP10P09238 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MMP10P09238 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MMP10P09238 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MMP10P09238 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MMP10P09238 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MMP10P09238 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MMP10P09238 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MMP10P09238 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MMP10P09238 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MMP10P09238 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MMP10P09238 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MMP10P09238 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MMP10P09238 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MMP10P09238 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MMP10P09238 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MMP10P09238 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MMP10P09238 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MMP10P09238 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MMP10P09238 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MMP10P09238 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MMP10P09238 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MMP10P09238 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MMP10P09238 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MMP10P09238 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MMP10P09238 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MMP10P09238 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MMP10P09238 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MMP10P09238 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MMP10P09238 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MMP10P09238 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MMP10P09238 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MMP10P09238 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MMP10P09238 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MMP10P09238 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MMP10P09238 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms