Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRCP08575 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRCP08575 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
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