Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEFLP07196 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEFLP07196 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEFLP07196 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEFLP07196 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NEFLP07196 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEFLP07196 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEFLP07196 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEFLP07196 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEFLP07196 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEFLP07196 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEFLP07196 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEFLP07196 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEFLP07196 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEFLP07196 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEFLP07196 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEFLP07196 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEFLP07196 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEFLP07196 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEFLP07196 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEFLP07196 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEFLP07196 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEFLP07196 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEFLP07196 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEFLP07196 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEFLP07196 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEFLP07196 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
NEFLP07196 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
NEFLP07196 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NEFLP07196 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NEFLP07196 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NEFLP07196 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NEFLP07196 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NEFLP07196 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NEFLP07196 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
NEFLP07196 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NEFLP07196 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NEFLP07196 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NEFLP07196 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NEFLP07196 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEFLP07196 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEFLP07196 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEFLP07196 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEFLP07196 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEFLP07196 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEFLP07196 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEFLP07196 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEFLP07196 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEFLP07196 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEFLP07196 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEFLP07196 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEFLP07196 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEFLP07196 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEFLP07196 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NEFLP07196 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEFLP07196 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEFLP07196 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEFLP07196 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEFLP07196 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEFLP07196 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEFLP07196 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEFLP07196 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEFLP07196 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEFLP07196 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEFLP07196 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEFLP07196 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEFLP07196 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEFLP07196 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEFLP07196 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEFLP07196 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEFLP07196 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEFLP07196 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEFLP07196 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEFLP07196 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEFLP07196 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NEFLP07196 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEFLP07196 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEFLP07196 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEFLP07196 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEFLP07196 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEFLP07196 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEFLP07196 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEFLP07196 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEFLP07196 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEFLP07196 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEFLP07196 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEFLP07196 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEFLP07196 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEFLP07196 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEFLP07196 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEFLP07196 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEFLP07196 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEFLP07196 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEFLP07196 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEFLP07196 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEFLP07196 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEFLP07196 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEFLP07196 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEFLP07196 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEFLP07196 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms