Protein–RNA interactions for Protein: O96018

APBA3, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA3O96018 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APBA3O96018 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APBA3O96018 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APBA3O96018 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
APBA3O96018 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APBA3O96018 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
APBA3O96018 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
APBA3O96018 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
APBA3O96018 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
APBA3O96018 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APBA3O96018 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
APBA3O96018 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APBA3O96018 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
APBA3O96018 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APBA3O96018 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APBA3O96018 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APBA3O96018 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APBA3O96018 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
APBA3O96018 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APBA3O96018 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
APBA3O96018 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APBA3O96018 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APBA3O96018 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APBA3O96018 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
APBA3O96018 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
APBA3O96018 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
APBA3O96018 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
APBA3O96018 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APBA3O96018 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APBA3O96018 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APBA3O96018 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APBA3O96018 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
APBA3O96018 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APBA3O96018 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APBA3O96018 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APBA3O96018 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APBA3O96018 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APBA3O96018 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APBA3O96018 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
APBA3O96018 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APBA3O96018 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APBA3O96018 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APBA3O96018 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APBA3O96018 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
APBA3O96018 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APBA3O96018 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APBA3O96018 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APBA3O96018 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APBA3O96018 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
APBA3O96018 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APBA3O96018 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
APBA3O96018 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
APBA3O96018 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
APBA3O96018 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APBA3O96018 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APBA3O96018 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APBA3O96018 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
APBA3O96018 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APBA3O96018 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APBA3O96018 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APBA3O96018 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APBA3O96018 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
APBA3O96018 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
APBA3O96018 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APBA3O96018 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APBA3O96018 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APBA3O96018 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
APBA3O96018 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
APBA3O96018 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
APBA3O96018 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
APBA3O96018 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APBA3O96018 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APBA3O96018 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APBA3O96018 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APBA3O96018 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
APBA3O96018 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APBA3O96018 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APBA3O96018 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
APBA3O96018 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
APBA3O96018 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APBA3O96018 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APBA3O96018 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APBA3O96018 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APBA3O96018 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APBA3O96018 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
APBA3O96018 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
APBA3O96018 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
APBA3O96018 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
APBA3O96018 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
APBA3O96018 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APBA3O96018 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APBA3O96018 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
APBA3O96018 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
APBA3O96018 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APBA3O96018 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APBA3O96018 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
APBA3O96018 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
APBA3O96018 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APBA3O96018 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
APBA3O96018 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms