Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZBED1O96006 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZBED1O96006 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZBED1O96006 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZBED1O96006 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ZBED1O96006 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZBED1O96006 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZBED1O96006 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ZBED1O96006 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZBED1O96006 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZBED1O96006 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZBED1O96006 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZBED1O96006 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZBED1O96006 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZBED1O96006 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZBED1O96006 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZBED1O96006 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZBED1O96006 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZBED1O96006 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZBED1O96006 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZBED1O96006 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZBED1O96006 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ZBED1O96006 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZBED1O96006 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZBED1O96006 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZBED1O96006 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZBED1O96006 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZBED1O96006 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZBED1O96006 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZBED1O96006 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZBED1O96006 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZBED1O96006 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZBED1O96006 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZBED1O96006 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZBED1O96006 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZBED1O96006 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZBED1O96006 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZBED1O96006 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZBED1O96006 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ZBED1O96006 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZBED1O96006 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ZBED1O96006 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZBED1O96006 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ZBED1O96006 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZBED1O96006 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZBED1O96006 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ZBED1O96006 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZBED1O96006 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZBED1O96006 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZBED1O96006 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZBED1O96006 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZBED1O96006 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZBED1O96006 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZBED1O96006 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ZBED1O96006 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZBED1O96006 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZBED1O96006 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZBED1O96006 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZBED1O96006 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZBED1O96006 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZBED1O96006 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZBED1O96006 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZBED1O96006 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZBED1O96006 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZBED1O96006 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZBED1O96006 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZBED1O96006 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZBED1O96006 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZBED1O96006 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZBED1O96006 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZBED1O96006 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZBED1O96006 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZBED1O96006 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZBED1O96006 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZBED1O96006 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZBED1O96006 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZBED1O96006 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZBED1O96006 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZBED1O96006 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZBED1O96006 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZBED1O96006 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZBED1O96006 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZBED1O96006 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZBED1O96006 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZBED1O96006 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZBED1O96006 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZBED1O96006 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZBED1O96006 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZBED1O96006 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZBED1O96006 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ZBED1O96006 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZBED1O96006 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ZBED1O96006 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZBED1O96006 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZBED1O96006 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZBED1O96006 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZBED1O96006 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZBED1O96006 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZBED1O96006 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZBED1O96006 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
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